再生医療の分野では、最終製品のエンドトキシン試験に使用することが可能です。
厚生労働省の「ヒト（自己）由来細胞・組織加工医薬品等の品質及び安全性の確保に関する指針に係るQ&Aについて」においては、エンドトキシン試験の手法は日本薬局方収載の試験方法を「参考」にするように述べられています。

【参考】 ヒト（自己）由来細胞・組織加工医薬品等の品質及び安全性の確保 に関する指針に係る Q&A について