異なるロットのキャリブレーションコードを入力して、そのまま試験を行ってしまいました。得られた値をそのまま使用することはできますか？

ロット毎に割り当てられているキャリブレーションコードには保存検量線の情報が組み込まれています。別のロットのキャリブレーションコードを使用すると正しい測定結果が得られませんので、正しいキャリブレーションコードを用いて再測定を行ってください。なお、測定終了後にキャリブレーションコードを修正することはできません。
詳しくは弊社までご相談ください。